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微软最新 AI 研究：用深度学习解析蛋白质动态，BioEmu 让分子模拟进入 AI 时代！
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ActSeek：精准挖掘 AlphaFold 数据库中的功能蛋白，揭示酶与药物脱靶新天地
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David Baker团队Nature在线重磅发布：Seq2Symm颠覆蛋白对称性预测！
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英伟达联合 MIT 最新发布 Proteína：AI 生成蛋白结构，精准操控折叠，掀起生物设计革命！
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重磅！上海交大团队突破蛋白质-DNA相互作用预测，ProDMM模型引领合成生物学新篇章！
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麻省理工联合英伟达颠覆蛋白设计！ProtComposer用3D椭球“绘制”生命分子新蓝图
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听懂人话的蛋白模型：当AI成为“生物学家”，用自然语言破解生命的密码，揭开DNA、RNA与蛋白质的神秘对话！
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蛋白质结构预测迎来新王者？ESMFold用语言模型颠覆传统，AlphaFold的地位还稳吗
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AlphaFold、Protenix、Chai-1、Boltz-1——谁才是蛋白-短肽预测的最强王者？
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香港中文大学（深圳）团队发布SCOPE-DTI，AI直击新药研发痛点，破解药物-靶点匹配难题！
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密苏里大学重塑蛋白质解析新纪元：冷冻电镜+AlphaFold3，破解结构生物学终极难题
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AlphaFold2又迎来升级！耶路撒冷-麻省理工团队推出全新actifpTM评分方法，精准解析蛋白-肽互作
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打破AlphaFold 3、Boltz-1和Chai-1之间的壁垒！利物浦大学团队推出ABCFold，让AI结构预测更简单
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AlphaFold 3预测D-肽翻车！杜克大学团队揭秘：AI竟然“误判”手性，高达 51% 预测像是在掷硬币？
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圣彼得堡大学震撼发布新一代蛋白质结合预测神器：PCANN模型登场，刷新蛋白质结合亲和力预测精度
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扩散模型也能建模蛋白质？InstaDeep团队用Latent Diffusion打开蛋白AI新思路
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交大重磅出击！首创CHIEF深度集成模型，功能蛋白设计成功率100%，颠覆AI结构生物学认知！
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AlphaFold结构太“脏”？交大E3former横空出世，一招化解蛋白质表示学习的鲁棒性危机！
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AlphaFold不仅预测结构，还揭示折叠奥秘：华沙大学解锁250万蛋白“套索拓扑”，首次发现超螺旋与打结共存的奇异构象！
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仅用一张3090显卡，南京理工大学造出“轻量版AlphaFold”！蛋白结构预测进入“低门槛”时代！
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苏州大学联合北京大学发布ProtTeX模型：让大语言模型“读懂”蛋白结构，实现功能预测与可控设计
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模型做得很漂亮，但离实验太远？交大发布VENUSFACTORY，让AI真正服务蛋白科研
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清华、字节、人大联合发布UniMoMo：首个通吃小分子、抗体、多肽的3D生成模型！
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Nature Methods 在线发布！David Baker团队推出 LigandMPNN，精准建模蛋白-配体相互作用
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湖北大学用一套模型让AI看懂蛋白的“语言”和“形状”—推动蛋白功能注释从粗略匹配迈向智能理解！
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浙江工业大学 × 西湖大学联合发布DeepSCFold模型：从蛋白序列精准推断结构互补性
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AlphaFold2不只是画结构，它还能识别抗药突变！江苏理工用AI判断药物还能不能用
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登顶《Nature Biotechnology》！蛋白成像通量实现重大突破，魏茨曼团队发布AI赋能的CombPlex技术
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首次引入AlphaFold结构信息！哈工大提出MSNGO，攻克多物种蛋白功能注释难题
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首次实验验证！西湖大学Pinal模型从自然语言生成蛋白序列，并成功验证其具有酶活性功能！！！！
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质谱界的ChatGPT来了！InstaDeep × DTU推出InstaNovo，看谱、猜肽、还能修正
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Nature Methods重磅｜清华发布百亿参数蛋白大模型，xTrimoPGLM统一理解与设计
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用主动学习预测蛋白结构？Sanofi团队提出DEWDROP新策略，效果超AlphaFold选样！
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不是AlphaFold，不是ProtGPT！InstaDeep用Bayesian Flow模型杀入蛋白设计C位
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MIT团队重磅发布蛋白设计新框架：BoltzDesign1，反向操作结构预测模型！
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AlphaFold之后，AI如何“设计”蛋白质？| 解读伯克利BAIR团队最新模型 PLAID
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让AI“看见”蛋白质的修饰！杜克大学发布PTM-Mamba模型，引领下一代蛋白功能建模
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Baker团队炸场！RFdiffusion2能从原子坐标直接“写出酶”，还真能干活！
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FeNNix-Bio1攻克原子级分子动力学：AI一体建模反应性、自由能与蛋白折叠
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德国格赖夫斯瓦尔德大学团队发布 af3cli：一键生成 AlphaFold3 输入文件，结构预测再无门槛！
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Duke×Cornell发布duAb新工具，AI设计肽精准稳定癌症关键蛋白p53
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不是最稳就被选！最新研究揭示AlphaFold2预测偏好“进化真相”:构象其实可被诱导出来！
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浙大发布全新蛋白生成模型ProtFlow：压缩语言模型潜空间，一步生成高质量蛋白!!
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浙工大团队发布 MeDCycFold 模型：一键预测“难搞”环肽结构，速度提升 49 倍！
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AlphaFold2还能干啥？哥本哈根-牛津团队开发AF2χ，揭示蛋白侧链柔性新维度！
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哥大团队更新力作！ESMDance 横空出世，AI 首次捕捉蛋白动态揭示突变效应
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密苏里大学发布 MPBind 模型：首个融合蛋白语言模型与 EGNN 的多任务结合位点预测框架
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ChatGPT也懂蛋白结构？UCLA联合Meta 发布ProteinGPT，蛋白结构与功能可对话！
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AI蛋白设计大逃杀：BindCraft、RFdiffusion、Cradle谁能胜出
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最新开源！蛋白结构标记神器 AminoAseed + StructTokenBench 全面来袭
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MultiFOLD2与ModFOLDdock2登场：蛋白质复合体结构预测与质量评估新标准
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中科大与北大联合推出 BioMiner 系统，加速蛋白-配体生物活性数据自动化提取
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AI 构建新一代亲和力预测框架：PPI-Graphomer 重塑 PPI 建模范式！
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突破AlphaFold的“静态限制”！DiffPIE模型首次实现蛋白质在环境作用下的动态构象生成！
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DeepMolecules重磅发布：只要有序列，就能预测酶底物、转运特性和催化参数的全能AI工具！
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上海科技大学最新力作PhysDock：AI预测蛋白-配体复合物迈入“物理真实”时代！
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精准操控蛋白构象与功能！斯坦福发布Conformational Biasing设计策略
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匹兹堡 × 浙工大团队推出EpiMII模型：MHC-II表位设计精准度超ProteinMPNN 4.2倍
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突破AlphaFold2极限！浙江工业大学M‑DeepAssembly，刷新多结构域蛋白预测上限
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一站式蛋白结构分析神器再升级！ProteinsPlus 2025 全新工具与工作流详解
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结构比对新时代！GTalign-web 发布：在 2500 万蛋白中飞速找出真正的同源者
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“打败 AlphaFold 的 Loop 预测神器”？浙江大学重磅发布 AutoLoop！
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SaprotHub打造蛋白质建模的开源协作新生态：OPMC推动蛋白语言模型社区共建共享
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序列到结构、再到能量变化：ProBASS联手ESM2+ESM-IF1，解决蛋白突变预测难题！
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一个大模型，搞定预测、设计、筛选、重构！GeoFlow-V2重新定义蛋白生成AI
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纳米抗体设计的 AI 突破！nanoFOLD 开启“逆折叠”驱动的精准序列生成时代
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AlphaFold跑不动长蛋白？LightNobel提出新方案，显存降低百倍、速度提升八倍
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从设计到合成一步到位！新框架 Saturn 实现“可控反应生成”，AI 分子设计进入实用时代！
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ProteinMPNN+AbLang：结构模型为何在 CDR 抗体设计上“翻车”？语言模型如何拯救？
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ProteinMPNN升级版？浙工团队推出HighMPNN让环肽设计不再“靠运气”
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从氨基酸到自然语言｜Prot2Text-V2 如何用大模型“讲出”蛋白质的功能？
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AlphaFold的盲区，RareFold的主场：29种非天然氨基酸全建模无压力
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《Nature Biotechnology》重磅发表：D-I-TASSER挑战AlphaFold王座
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复旦上交FoldBench评测平台，AlphaFold 3一骑绝尘，抗原预测仍是难点
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百度团队重磅上线 HelixDesign-Binder：蛋白结合物设计一体化平台
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NSMB | AlphaFold应用场景解析：补全Cryo-EM无法解析的IDR区段，精确指导点突变实验
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AlphaFold3 不只是预测结构，它还能帮你筛药？清华团队重磅提出 AlphaRank
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山东大学创新模型 trRosettaX2-Dynamics，推动蛋白结构预测走向动态时代
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为什么别人用 AlphaFold 预测结构比你准？他们偷偷用了这个“模型大礼包”
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AlphaFold3能把结构折得完美，CASP16却发现：AI还不会判断哪个结构才真正可用！
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别再被高pLDDT分数骗了！AlphaFold2偏爱理想结构，UCSF团队出手修正！
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AlphaFold已经够强了？那你可能还没见过“结构预测加强版”MULTICOM！
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NVIDIA 推出 Boltz-2 在线预测平台，蛋白结构预测一键搞定！支持API调用！！！！
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一键交互，AI生成结合抗体！Diffuse发布革命性蛋白设计平台DiffuseSandbox
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让 AlphaFold3 都甘拜下风？PIONEER2.0 为 48%蛋白互作预测打开新大门
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蛋白也能“精心设计”？看看 AlphaDesign 如何用 AI 打造“定制蛋白”
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预测更精准，结构更真实：DistPepFold如何进化AlphaFold对接能力
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PoET-2 全解析：支持插入缺失预测，OpenProtein.AI 如何用小模型颠覆蛋白质设计
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BLAST 找不到，Foldseek看不懂，AI 上场！Gaia 用上下文搞定功能注释
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AlphaFold2 最准，ESMFold 最快？三款蛋白结构预测软件实测对比来了
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AlphaFold核心更新模块开放优化：Triangle Multiplicative Update竞赛启动
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《Nature Machine Intelligence》发表清华新模型TopoDiff：突破β折叠结构设计瓶颈
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AI 学会“挑能量低的蛋白”：上海交大发布 EnerBridge-DPO 新模型
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Nature Cancer | 用 AI 预测免疫疗效与副作用：德州大学团队发布抗体结合力大模型 Cmai
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上交×港科大联合发布 PRO-LDM：GFP 亮度提升 127 倍！实现蛋白功能定制化设计
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Nat. Commun. | AlphaFold 的“隐藏技能”：预测蛋白的多重形态！
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Sci Rep | AlphaFold太慢？IBM团队教你“蒸馏”出0.03秒结构评分器！
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纳米抗体设计成功率提升至19.5%，FoldCraft 重构 de novo binder 能力边界
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AlphaFold3 的对手来了！新模型 IntFold 开启“可控蛋白预测”时代
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Python 也能“发现新酶反应”？看 EnzyMS 如何帮酶催化研究提速 3 倍！
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AlphaFold3 升级插件 SiteAF3 登场：精准对接药物结合位点，效率更高！
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结构、功能、进化一次搞定？清华&上海人工智能实验室发布AMix-1打通蛋白设计全流程
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字节跳动 × 清华重磅发布 Protenix-Mini：用蛋白语言模型替代MSA，结构预测又快又准
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AI预测植物“免疫力”？UC伯克利团队开发新模型mamp-ml，准确率高达73%！
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Nat. Commun. | DeepTernary：TPD药物设计的AI加速引擎
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结构打分的“新金标”：NVIDIA × Schrödinger发布ToxBench 数据集与 DualBind 模型
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浙大×百度联手打造！BioScore通用评分模型，让蛋白、核酸、小分子统统一网打尽！
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Nat. Commun.｜上交AI模型VenusMine精准发现97倍活性的PET降解酶KbPETase
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什么都不用装！OmniFold直接打包AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2、RFdiffusion，一键跑全套！！
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ICML 2025 | 全原子逆折叠模型ADFLIP发布：支持多构象+非蛋白配体的序列设计方法
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蛋白复合物预测更准了！AF3Complex 正式发表上线《Bioinformatics》
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AlphaFold3被反超？中科大周少华&熊鹏团队RNA大模型三级结构预测更胜一筹
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什么？？RosettaFold 出 3 了？！Baker×DiMaio 团队合作之作
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AI能设计跨膜蛋白了？TMDiffusion：首个全原子跨膜蛋白设计扩散模型
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CASP16 模型质量评估大揭秘：谁能精准挑出好模型？
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预测蛋白稳定性的新工具：ProStab
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只看序列，AI 也能看出蛋白互作？ProteomeLM 震撼登场！
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不做实验也能训练AI？rbio-1开辟生物推理新路径
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RFdiffusion2 正式开源！
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植物也有了自己的ChatGPT？PlantDeBERTa来了，专为植物科研量身打造的AI模型！
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DynaRepo：首个宏观分子动力学开放库上线，助力AI理解分子如何“动”起来！
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CoMET：用生成式AI预测你的健康未来
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AI巨兽Boltz-2 结合传统分子对接工具Vina，虚拟筛选新王者Boltzina登场！
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吊打 RFdiffusion！斯坦福 2200 万参数小模型 Protpardelle-1c 横空出世
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实至名归！！BindCraft 登顶 Nature，AI蛋白设计最强选手出道即巅峰！
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史上最强分子AI之一！OrbMol发布！蛋白-配体结合打分 + 全蛋白模拟 + 1亿训练数据！
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Boltz 系列再更新！AI 药厂 Recursion 发布Boltz-ABFE！自由能计算彻底无结构！
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AlphaFold 3 也能“看懂”糖链？一文带你入门
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智药元创与上交大联合打造“AI设计新引擎”，ProDualNet精准生成双靶蛋白序列！
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中国原创！石油大学王淑栋团队发布AlphaPPIMI：突破PPI成药难题的AI利器！！
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从AI抗癌先锋，到Boltz-2革命的缔造者｜MIT教授 Regina Barzilay
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FreeBindCraft：真正意义上的开源蛋白质设计平台来了！
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AI蛋白模型的底座在哪？Logan直接接入全地球基因序列！AI生物模型再也不缺“粮”了！
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全能生物分子结合蛋白生成器！湖南大学彭绍亮团队AI力作EiRA
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只靠序列搞定多肽设计！深圳大学朱泽轩团队发布PepCCD！挑战RFDiffusion霸主地位！
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RareFold重磅更新！！29种非天然氨基酸设计肽首次通过人源免疫学验证
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史诗级更新！全原子蛋白设计模型La-Proteina正式开源！！！
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Boltz-2无法胜任分子胶预测！AI模型在真实药物任务中遭遇滑铁卢！！
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Nature Methods | AlphaFold3被碾压？北大&昌平实验室高毅勤团队发布GRASP模型
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通用抗体设计大模型！！腾讯AI开源新工具，一站式颠覆抗体研发流程
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David Baker再立里程碑！！！RFdiffusion3带来真正意义上的全原子AI蛋白设计模型！！
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AI蛋白设计基础设施再升级，MMseqs2推出GPU加速版本，蛋白同源搜索提速199倍！
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AI环肽新突破！CycleRFdiffusion成功设计出能结合TREM2的分子
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AI 抗体设计新突破！斯坦福 & Arc 推出 Germinal，几十个候选就能成功！！
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苹果跨界AI生物！SimpleFold无MSA挑战AlphaFold！折叠蛋白从此不再复杂！！
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上海AI实验室重磅发布SciReasoner！首个覆盖 DNA-蛋白-材料-分子的通用科学推理大模型！
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AI 引爆三模态蛋白革命！西湖大学ProTrek 从预印本到顶刊的进化之路
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当AI蛋白模型开始学会思考，它在思考什么？港中文&北大&斯坦福团队带来他们的解答
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Nature重磅｜EZSpecificity打通AI+酶学全流程：建数据库、造模型、做实验一篇全包！
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全模态AI分子设计师 ODesign 发布！真的这么全能？
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全民共折叠时代开启！OpenFold3发布！全开源可商用的蛋白-核酸-小分子基础模型！
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AI 从零构建原子级抗体，David Baker 团队 RFdiffusion 登顶 Nature！
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能写抗体的AI语言模型！登顶Cell！
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西湖大学HalluDesign！把幻觉变成创造力，重新定义AI蛋白设计！
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交大团队“魔改”AlphaFold3成AI抗体设计器？准确率直接翻两倍！
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蛋白复合物预测的“后MSA时代”！浙工大×Nat. Commun.最新成果！
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“千万级” Cryo-EM 大模型！西湖大学Nat Methods新作！AI 带你“自动驾驶”做电镜！
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“全原子”结构预测模型狂欢背后的一地鸡毛
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字节开源 PXDesign！实验命中率碾压主流蛋白设计模型！
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生物大模型的困境，十年前就已被预言
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AI驱动的新药突破：英矽智能的 ISM001-055 或成抗衰老新希望
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