Ligand-Conditioned Protein Design Pipeline for AI Agents
配体驱动蛋白设计 + 虚拟筛选闭环工作台
整合 EnzyGen2 蛋白生成 + ESMFold 结构预测 + AutoDock Vina 对接 + ADMET 评估,端到端 GPU 加速。
输入: 配体 SMILES + Rhea Motif ID
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│ EnzyGen2 蛋白序列生成 │
│ (配体条件化,设计与该配体结合的蛋白) │
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│ ESMFold 结构预测 │
│ (GPU加速,生成3D结构) │
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│ AutoDock Vina 分子对接 │
│ (评估蛋白-配体结合亲和力) │
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│ ADMET + PAINS + SA 评分 │
│ (药物代谢动力学/毒理/合成难度) │
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综合排名输出
JSON报告 / CSV排名 / PDB结构